Upravni sud RH presudio je u korist Ministarstva zaštite okoliša u sporu s Gradom Siskom vezanom uz naplatu komunalnog doprinosa JANAF-u za izgradnju 5 spremnika nafte, a u kojem je, kako smatra pročelnik Upravnog odjela za komunalne djelatnosti Mile Mikić, Ministarstvo pogodovalo ovoj državnoj tvrtki. Mikić je podsjetio kako je Grad Sisak izdao rješenja JANAF-u o visini komunalnog doprinosa za izgradnju 5 spremnika u iznosu od 54 milijuna kuna. Iznos se temeljio na Zakonu po kojem se doprinos izračunavao po obujmu spremnika, no Janaf je uplatio tek 3 milijuna kuna doprinosa obračunavajući ga po površini i opravdavajući izračun plutajućim krovom građevine.

– JANAF je uplatio taj iznos i temeljem potvrde o uplati dobio potrebne građevinske dozvole od nadležnog Ministarstva. Ministarstvo je pak ukinulo rješenja Grada Siska pravdajući se kako su građevine koje imaju tzv. plutajući krov otvorene građevine. Naime, kod zatvorenih se doprinos određuje prema obujmu, a kod otvorenih se određuje prema površini. Ako uzmemo u obzir kako je riječ o spremnicima koje je država radila kako bi osigurala državne rezerve, za pretpostaviti je da oni neće biti prazni, već puni. Kad su puni, istog su kapaciteta kao prijašnji spremnici koji se nalaze samo nekoliko metara dalje, a za koje je JANAF platio doprinos od 11 milijuna kuna  po spremniku – rekao je Mikić i dodao kako je Grad na rješenje uložio tužbu 2009. godine, no Upravni sud je presudio u korist Ministarstva. Mikić spornim smatra izmjene Pravilnika o načinu utvrđivanja zapremine građevina za obračun komunalnog doprinosa koji je omogućio ovakvo pogodovanje JANAF, a koje je Ministarstvo donijelo tek 2010. kada je predmet već bio na sudu. 

– Ministarstvo je Pravilnik donijelo naknadno kako bi opravdalo svoj postupak, pa nije niti bilo za očekivati da će presuda biti drugačija. Uvažavajući presudu mi moramo donijeti nova rješenja i primijeniti novi Pravilnik jer se moramo držati zakona. Ono što Sisku preostaje i što razmatramo je izvanredni pravni lijek – zaključio je Mikić.